Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col4a3Q9QZS0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a3Q9QZS0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3Q9QZS0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3Q9QZS0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3Q9QZS0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms