Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Six6Q9QZ28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Six6Q9QZ28 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms