Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx4Q9QY61 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx4Q9QY61 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms