Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY24

Zbp1, Z-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbp1Q9QY24 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbp1Q9QY24 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbp1Q9QY24 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Zbp1Q9QY24 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbp1Q9QY24 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbp1Q9QY24 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbp1Q9QY24 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbp1Q9QY24 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.5 ms