Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn4Q9QXZ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn4Q9QXZ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms