Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcea2Q9QVN7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcea2Q9QVN7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcea2Q9QVN7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tcea2Q9QVN7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tcea2Q9QVN7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcea2Q9QVN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcea2Q9QVN7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcea2Q9QVN7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms