Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dkk3Q9QUN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dkk3Q9QUN9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms