Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfmbt1Q9JMD1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms