Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdc42ep4Q9JM96 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc42ep4Q9JM96 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc42ep4Q9JM96 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms