Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cabp1Q9JLK7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cabp1Q9JLK7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cabp1Q9JLK7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cabp1Q9JLK7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cabp1Q9JLK7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms