Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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