Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bco1Q9JJS6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco1Q9JJS6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco1Q9JJS6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms