Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn19Q9ET38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn19Q9ET38 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn19Q9ET38 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms