Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm7Q9ESD6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm7Q9ESD6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm7Q9ESD6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms