Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mkrn2Q9ERV1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn2Q9ERV1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkrn2Q9ERV1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkrn2Q9ERV1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mkrn2Q9ERV1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms