Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col4a3bpQ9EQG9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3bpQ9EQG9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms