Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sil1Q9EPK6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sil1Q9EPK6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sil1Q9EPK6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sil1Q9EPK6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sil1Q9EPK6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms