Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl4Q9DCU6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl4Q9DCU6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms