Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB8

Isca2, Iron-sulfur cluster assembly 2 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isca2Q9DCB8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Isca2Q9DCB8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Isca2Q9DCB8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Isca2Q9DCB8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Isca2Q9DCB8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Isca2Q9DCB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Isca2Q9DCB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Isca2Q9DCB8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Isca2Q9DCB8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Isca2Q9DCB8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Isca2Q9DCB8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Isca2Q9DCB8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Isca2Q9DCB8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Isca2Q9DCB8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 467.6 ms