Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MNCb-2875Q9DCB3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms