Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf6Q9DBU5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf6Q9DBU5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf6Q9DBU5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms