Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem239Q9DA47 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms