Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bpifa3Q9D9J8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa3Q9D9J8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bpifa3Q9D9J8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms