Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf2Q9D8U4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C1qtnf2Q9D8U4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1qtnf2Q9D8U4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1qtnf2Q9D8U4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms