Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl17Q9D8P4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl17Q9D8P4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl17Q9D8P4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl17Q9D8P4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl17Q9D8P4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms