Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4ipQ9D7Y9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4ipQ9D7Y9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slx4ipQ9D7Y9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4ipQ9D7Y9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms