Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med8Q9D7W5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med8Q9D7W5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms