Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl40Q9D783 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl40Q9D783 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klhl40Q9D783 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.5 ms