Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsmce1Q9D720 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce1Q9D720 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms