Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdr42e1Q9D665 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sdr42e1Q9D665 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdr42e1Q9D665 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdr42e1Q9D665 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdr42e1Q9D665 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms