Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms