Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syap1Q9D5V6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syap1Q9D5V6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syap1Q9D5V6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syap1Q9D5V6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syap1Q9D5V6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syap1Q9D5V6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms