Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930513O06RikQ9D549 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930513O06RikQ9D549 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930513O06RikQ9D549 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930513O06RikQ9D549 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
4930513O06RikQ9D549 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930513O06RikQ9D549 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930513O06RikQ9D549 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930513O06RikQ9D549 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930513O06RikQ9D549 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms