Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Taf1dQ9D4V4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Taf1dQ9D4V4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Taf1dQ9D4V4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Taf1dQ9D4V4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Taf1dQ9D4V4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms