Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp4Q9D4F8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubgcp4Q9D4F8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms