Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap53Q9D439 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap53Q9D439 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap53Q9D439 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms