Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D3J9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D3J9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D3J9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D3J9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D3J9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D3J9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D3J9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D3J9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D3J9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D3J9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D3J9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D3J9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D3J9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D3J9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D3J9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D3J9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D3J9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D3J9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D3J9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D3J9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D3J9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D3J9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D3J9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms