Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vsig1Q9D2J4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vsig1Q9D2J4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsig1Q9D2J4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsig1Q9D2J4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vsig1Q9D2J4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vsig1Q9D2J4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vsig1Q9D2J4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsig1Q9D2J4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsig1Q9D2J4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsig1Q9D2J4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms