Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim42Q9D2H5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim42Q9D2H5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms