Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl28Q9D1B9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mrpl28Q9D1B9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms