Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lsm12Q9D0R8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm12Q9D0R8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm12Q9D0R8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms