Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mms19Q9D071 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mms19Q9D071 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mms19Q9D071 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mms19Q9D071 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms