Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm8Q9CZR4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm8Q9CZR4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtm8Q9CZR4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm8Q9CZR4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms