Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ6

Rex1bd, Required for excision 1-B domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rex1bdQ9CYZ6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rex1bdQ9CYZ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rex1bdQ9CYZ6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rex1bdQ9CYZ6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rex1bdQ9CYZ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms