Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700029F12RikQ9CRB4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms