Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pop4Q9CR08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pop4Q9CR08 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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