Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg12Q9CQY1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg12Q9CQY1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg12Q9CQY1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg12Q9CQY1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms