Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim8Q9CQQ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim8Q9CQQ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim8Q9CQQ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms