Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nicn1Q9CQM0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nicn1Q9CQM0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nicn1Q9CQM0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms