Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufb5Q9CQH3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb5Q9CQH3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufb5Q9CQH3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufb5Q9CQH3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms